基本的に以下のサイトの手順通りに進めていけばSSL化できます。

【無料SSL】サーバコントロールパネルからの導入手順 – さくらのサポート情報

簡単にまとめると以下の通り。

1. サーバコントロールパネルへログインする。
2. “ドメイン/SSL設定”をクリックする。
3. xxx.sakura.ne.jpの行のSSL > 証明書の列の“登録”をクリックする。
4. “無料SSL設定へ進む”をクリックする。
5. “無料SSLを設定する”をクリックする。

基本的に以下のサイトの手順通りに進めていけば常時SSL化できます。

.htaccessによるアクセス制御 – さくらのサポート情報

基本的には

~/www/.htaccess

を作成して以下のように書き込めばいいです。

RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTPS} off
RewriteRule ^(.*)$ https://%{HTTP_HOST}%{REQUEST_URI} [R=301,L]

ただ、DokuWikiに関しては、dokuwikiの下にも.htaccessがあるので、そちらの方の一番下に追記する必要があります。